La chiesa sorge nel centro storico cittadino, accanto alle antiche mura e alla chiesa di San Francesco.
In origine l’oratorio di San Marcello doveva sorgere proprio accanto alla chiesa di San Francesco, ma nell’Ottocento l’amministrazione cittadina decise di costruire su quel sito una scuola, demolendo una parte delle antiche mura e traslando l’edificio ecclesiastico.
La costruzione della chiesa risale al XVI-XVII secolo ad opera della confraternita di San Marcello; nel XX secolo, su progetto dell’ingegnere Luigi Degrossi, l’edificio è ricostruito riutilizzando parte dei materiali.
Della struttura originaria si mantiene la facciata di gusto gotico, caratterizzata dal rosso della trachite. Questa presenta terminale a cuspide, racchiuso da paraste angolari e decorato da una doppia teoria dei archetti trilobati. Il portale è sormontato da un arco ogivale con crocetta apicale e oculo modanato.